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按显微镜原理分类
要是我们依据显微镜原理来对它进行分类的话，通常可以分为光学显微镜与电子显微镜。所谓的光学显微镜其实就是简单由光学部分、照明部分和机械部分组成的观察设备。这其中最关键的就是光学部分了，它主要的组成部分就是目镜和物镜组成。显微镜的历史可以追溯到1590年，在当时荷兰和意大利的眼镜制造者就已经制造出与显微镜功能向类似的放大仪器了。
而目前市场上光是光学显微镜就有很多种，比如说明视野显微镜、暗视野显微镜、荧光显微镜等等。电子显微镜主要利用的就是电子与物质作用所产生之讯号来监定微区域晶体结构，微细组织，化学成份，化学键结和电子分布情况的电子光学装置。我们身边常用的电子显微镜就有透射电子显微镜和扫描电子显微镜等
按照显微镜功能进行分类
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